马融俊才善文，曾从京兆（今属西安市）处士挚恂问学。汉安帝时，任校书郎，诣东观（朝廷藏书处）典校秘书。因得罪当权的外戚邓氏，滞于东观，十年不得升官。直到邓太后死后，才召拜郎中。汉桓帝时，外任南郡太守，因忤大将军梁冀，遭诬陷，免官，髡徙朔方。后得赦，复拜议郎，重在东观著述，以病辞官，居家教授。他达生任性，不太注重儒者节操，常坐高堂，施绛纱帐，前授生徒，后列女乐，开魏、晋清谈家破弃礼教的风气。其学生多达四百余人，升堂入室者有五十余人，其中郑玄、卢植是佼佼者。 马融博通今古文经籍，世称“通儒”。长期在东观校书著述，为他能综合各家之学，遍注古文经典，提供了十分有利的条件。他善于吸取前人的学术研究成果，他曾想训解《左氏春秋》，及见贾逵、郑众的著作，就说：“贾君精而不博，郑君博而不精。既精即博，吾何加焉！”（《后汉书·马融列传》）他综合了贾、郑二家的优点，撰成《春秋三传异同说》，是《春秋》学集大成的一部专著。马融还与北地太守刘环讨论过《春秋》学的一些分歧问题。据考证，马融注《易》，源于《费氏易》，又杂采子夏之说以及孟氏、梁丘氏、京房氏诸家《易》学。注《尚书》，取郑氏父子和贾逵之说。注《诗》，除《毛氏诗》外，兼采《韩诗》。此外，马融注《三礼》、《孝经》、《论语》；甚至注《老子》、《淮南子》、《离骚》、《列女传》（刘向撰）等。他还著赋、颂、碑、诔、书、记、表、奏、七言、琴歌、对策、遗令，凡二十一篇。 马融之学，属于古文经学中的一种典型。在儒家经学的发展史上，马融开始了综合各家、遍注群经这种带有开创性的工作，他的经注成就，使古文经学开始达到成熟的境地，预示着汉代经学发展将步入新的时期。马融的经学著作多已佚。清人马国翰《玉函山房辑佚书》黄 《汉学堂丛书》有部分辑录。
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