目前发现的神龙翼龙科化石大部分保存不完整,所以古生物学家对于神龙翼龙科的生活方式存在很多争议。一些古生物学家认为神龙翼龙科的生活方式类似现生的鹳类,在岸边和陆地上一边散步一边捕食。
但是,一些古生物学家提出了不同观点。俄罗斯科学院动物学研究所的A.O. Averianov最近观察了乌兹别克斯坦上白垩统土伦阶地层发现的神龙翼龙颈椎化石,并使用计算机重建了神龙翼龙的颈椎三维模型。
A.O. Averianov发现神龙翼龙科颈椎的相对比例为第一+第二<第三<第四<第五>第六> > 第七>第八>第九颈椎,和其他短颈椎的翼手龙亚目相同。但是,神龙翼龙科的中部第四到第六颈椎颈部长度增加。
以前大部分重建认为神龙翼龙科在站立的时候颈部笔直伸出,但是实际应该为S形弯曲,第四颈椎到第五颈椎、第五颈椎到第六颈椎之间的最大角度为20°,第八颈椎到第九颈椎之间的最大角度为17°。
A.O. Averianov认为神龙翼龙科的生活方式可能类似现生的鹈鹕,神龙翼龙科首先在大型内陆或近岸海洋水体上空飞行寻找猎物(可能主要是鱼类),然后张开大嘴把猎物吞入喉囊。
A.O. Averianov还认为神龙翼龙科不太可能岸边和陆地捕食,因为神龙翼龙科在陆地上是非常笨拙的动物,很容易受到捕食。
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