1636年，皇太极将国号改为 “清”，同时也改元“崇德”。1644年李自成攻入北京，明朝覆灭。清军一路屠杀，收买汉奸，逐步攻取全中国政权，最终建立统一中央王朝??清朝。清军入关之初，为了巩固统治，从外貌上消除汉满差异，防止激起汉人知识分子的华夷之辨，下令“剃发易服”。但是剃服令却激起了汉人民众强烈的排斥反抗，清军对汉人民众进行了残酷的屠杀，从北杀到南，制造弥天大罪，导致人口锐减，社会经济文化倒退。清代广泛实施文字狱，钳制知识分子思想。

在稳固统治之后，清帝逐渐进行补救。先后追尊崇祯帝庙号，兴建帝陵等。在官方史书中，亦悲悯崇祯帝“非亡国之君”。称李自成“流寇等。清军入关之初的屠戮和文字狱客观上是使得中国经济文化倒退，社会进一步走向保守，封闭，中国近代积贫积弱由此出。

康熙时期，准噶尔部首领噶尔丹在俄国政府的怂恿支持下，于康熙二十七年(1688)进攻喀尔喀蒙古，并借口追击土谢图汗部余众，进军内蒙古乌朱穆沁。 康熙帝3次率军亲征漠北。二十九年七月，他亲自进驻博洛河屯(今河北隆化)节制全军。八月一日两军在乌兰布通(今内蒙古克什克腾旗境内)交战。噶尔丹仅率数千人逃回科布多。

三十四年五月，东犯克鲁伦河(今蒙古国境内)以北巴颜乌兰。三十五年五月，康熙帝命费扬古统帅清军在昭莫多(今蒙古乌兰巴托南之宗莫德)与噶尔丹主力军队激战竟日，噶尔丹军阵大乱，清军追击30余里，歼敌数千。噶尔丹率残部仓皇西逃。次年春，康熙帝亲赴宁夏，进剿噶尔丹残部。同年三月，噶尔丹暴病而亡。继噶尔丹成为准噶尔部首领的策忘阿拉布坦，于五十五年进犯西藏。次年十一月攻占喇萨(今西藏拉萨)，造成西藏地方动乱。五十九年八月，清军进入喇萨，控制西藏政局，准噶尔残部逃回伊犁。

雍正时期，雍正五年(1727)噶尔丹策零继策妄阿拉布坦为准噶尔首领后，即遣使清廷要求派人入藏熬茶(向喇嘛寺庙发放布施)，清政府未允其请，并令噶尔丹策零将发动叛乱的青海和硕特部贵族首领罗卜藏丹津送回。一年之后， 雍正帝决意出兵准部。八年，噶尔丹策零押送罗卜藏丹津的队伍行至中途，探知清军西进来讨，便返回伊犁。九年六月噶尔丹策零大败清军。十年六月，噶尔丹策零进掠克鲁伦地区，与清军相遇，双方在额尔德尼昭(光显寺)激战，准噶尔军队中伏被围，仅噶尔丹策零等率残部突围。

乾隆时期，清政府为了完成对西北边疆地区的统一，曾两次出兵准噶尔部、进军伊犁。乾隆十年(1745)噶尔丹策零死。十七年达瓦齐在阿睦尔撒纳支持下夺取了准噶尔部统治权，不久两人又发生火并。十九年阿睦尔撒纳投清。清政府决定进军伊犁。二十年五月，达瓦齐退守格登山(今新疆昭苏县松柏边卡)，遭清军夜袭，达瓦齐越天山奔南疆，在乌什为回部霍吉斯擒获，押交清廷。八月，阿睦尔撒纳发动叛乱。清政府于二十一年三月占领伊犁，阿睦尔撒纳逃入哈萨克阿克赉牧地。

不久他又向俄国求援。二十二年二月清军再次进军伊犁。七月，阿睦尔撒纳兵败逃入俄境，不久死于痘疫。清政府通过上述战争，打击了准噶尔贵族上层的割据势力，统一了西北边疆，有力地抵制了俄国势力的扩张。

清王朝从维护政权长治久安的利益出发，在康乾盛世时期，进行了一系列巩固边疆、抵抗外国侵略、维护祖国统一的政治军事活动。如康熙年间，平息吴三桂“三蕃之乱”，维护了国家的统一;收复台湾，并设立一府三县，隶福建省。经过雅克萨反击战，阻止了沙俄侵略者对中国东北边疆的蚕食。清俄双方缔结了《中俄尼布楚条约》，划定中俄东段边界。

清政府历经康熙、雍正、乾隆三代，用了70余年时间，征服了雄踞西北的准噶尔蒙古汗国，统一了天山南北，设立伊犁将军严兵把守，粉碎了沙俄向中国西北边疆扩张的阴谋。在西藏地区，清政府选派驻藏大臣，实行政教合一的统治体制，并且确立了达赖与班禅转世的“金瓶掣签”制度，使西藏直接为中央政府所管辖。与此同时，清政府先后平定了上层贵族叛乱和受英国殖民主义者支持的廓尔喀(尼泊尔历史上的统治王朝)入侵，巩固了中国西南边疆。

清王朝的漫长统治中，中国国内各民族基本已结成比较稳固的政治、经济、文化联系。从近代鸦片战争以来，无论是帝国主义的武装侵略还是阴谋颠覆，都没能使中国重演历史上的分裂局面。大清王朝的建立和发展，最终确定了中国现代统一多民族国家的基本格局。而极盛时的清朝版图仅次于元朝，西抵葱岭和巴尔喀什湖北岸，西北包括唐努乌梁海地区，北至漠北和西伯利亚，东到太平洋(包括库页岛)，南达南沙群岛。从17世纪后半叶(康熙朝)到18世纪末(乾隆朝)，是中国帝制及传统社会的鼎盛时期。期间虽有战争，但工商业百年兴旺，人口升至3亿，竟占到当时全世界人口的三分之一。

可不幸的是，清王朝接着逐渐走入腐败没落之途。由于保守思想的沉积，闭关锁国和妄自尊大，当世界大变革风起云涌的时候，当中国必须直面西方势力的时候，却只能纠缠于内部错综复杂的矛盾之中，导致了中国近代史上的落伍。虽然清王朝在最后阶段，曾推行过一系列的“新政”，但为时已晚。尽管如此，没落的清王朝纵然一再被迫割地(总共割掉了150余万平方千米)，清帝退位时，仍给中国留下了1,140多万平方千米的辽阔疆域。

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