中书省有行中书省，御史台有行御史台，枢密院也有行枢密院，简称“行院”。《元史?百官志二》：“国初有征伐之事，则置行枢密院。大征伐，则止曰行院。为一方一事而设，则称某处行枢密院”。意谓“行院”与“行枢密院”是两种不同设置：为大征伐而设者，称“行院”；为一方一事而设者，称“行枢密院”。我们查看《世祖纪》，则知其误。至元十一年（公元1274年），元大举伐宋时，曾置荆湖、淮西二行院，记载中也称为行枢密院。可知行枢密院以外无行院，行院之外无行枢密院。《元史?世祖纪二》载，中统四年（公元1263年）七月“以成都经略司隶西川行院”。而《百官志三》则云：“西川行枢密院，中统四年始置”，可见“行院”与“行枢密院”是同一概念的不同说法。元代在各地设有下列行枢密院：西川行枢密院，中统四年始置，设官2员，管西川军民课税交钞，打捕鹰房人匠，及各投下应管公事，节制官吏诸色人等以及军官迁授征进等事。置治于成都。至元十年（公元1273年），又於重庆别置东川行枢密院，设官1员。十三年（公元1276年），并为一院。不久，再分东川行院。十六年（公元1279年），罢两川行院。二十八年（公元1291年），再立四川行院於成都。江南行枢密院，《百官志》中有此一条，但在叙述中却未提及这个行院。在其条下所举的行院是荆湖行院，淮西分院，扬州行院，岳州行院，均不全在江南。当时元朝为了攻取江南而设，故称江南行枢密院。甘肃行枢密院，至大四年（公元1311年），在甘州设治所，设官四员，提调西路军马。后以甘肃行省丞相提调，遂罢行院。河南行枢密院，致和元年（公元1328年）分置，专管调遣之事。天历元年（公元1329年）废除。岭北行枢密院，天历二年置。掌边庭军务，凡大小事宜，悉从裁决。顺帝至元三年（公元1337年），设置四川、湖广、江西、江浙四行院，次年即废。此后所设立的行院，皆是为了镇抚内乱而临时设置的。历史
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