分子构造（constitution）是指分子中原子相互联结的方式和次序，过去长期以来称为分子结构（structure），根据国际纯粹和应用化学联合会的建议，改为“构造”。“结构”一词应用在广泛的范围，例如物质结构、原子的电子结构等等。分子结构也具有广泛的含意，除包括分子构造外，还包括分子构型（configuration）和分子构象（conformation）等。从分子构造到分子构型和分

　　子构象是化学家们一个接一个对化学物质性质的研究逐渐认识到的，推动了化学科学的发展。

　　分子构造的研究是从同分异构体的出现开始的。

　　18世纪末、19世纪初，由于分析化学迅速发展，新的化合物不断被发现。19世纪20年代里，化学家们开始发现到一些物质的化学组成相同，但是性质各异。这在当时来说，是不可思议的。因为当时化学家们认为物质的性质只决定于它的组成，每一个物质有一固定的组成，这是18世纪末确立的定组成定律。后来，这个定律的逆定律也被确认，即具有相同组成的物质必定是同一种物质。现在竞然出现组成相同而性质各异的物质了。

　　贝齐里乌斯在1832年他编的《物理化学进展年报》中发表文章，指出“它们由相同元素的相同数目的原子组成，但是它们的原子按不同的方式排列，因而具有不同的化学性质。”并提出将相同组成而不同性质的物质称为isomers。这一词来自希腊文，“iso”是“相同”，“mer”是“部分”，直译就是“相同部分”，现在译为“同分异构体”。

　　同分异构体现象的发现开始了分子构造的研究。这种现象表明，物质分子的化学和物理性质不仅取决于组成分子的元素原子的种类和数目，而且还取决于原子的排列。

　　到1861年，俄罗斯化学家布特洛夫出席在德国斯拜尔（Speyer）召开的第36次自然科学家和医师代表大会，发表为《论物质结构》的演说，明确指出“一分子的性质决定于它基本组分的性质、数量和排列，这是已知的规则，这个规则现在可以修订成下列方式：一分子的化学性质决定于基本组分的性质和数量，还决定于它的化学结构。”

　　布特列洛夫明确分子构造是可知的，提出确定分子构造的途径。他说：“研究不同化合物化学结构的最好途径大概是合成它们。……另一方面，在某种程度上从分解过程也能确定化学结构。”布特列洛夫所说的“化学结构”正是“分子构造”。

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